當然不同的胎記治療時所選用的激光也是有差別的。治療血管性胎記的機理是選擇性作用于局部血紅蛋白，血紅蛋白吸收一定波長激光熱能后凝固封閉血管達到治療目的，對周圍組織損傷小;對色素性胎記的治療機理是皮損處色素細胞吸收特定波長激光能量后分裂成細小微粒被組織細胞吞噬，隨人體代謝排出體外。
而多數皮損需多次治療，一般每三個月左右治療一次。每次治療約需幾分鐘到幾十分鐘，治療后局部可能出現滲出、結痂、腫脹甚至水皰，5-7天結痂脫落，在這期間注意保護創面，避免日曬。
脈沖染料激光治療紅色胎記的應用廣泛。實踐證明這是一種安全、簡便的治療手段。激光能夠穿越菲薄的表皮，破壞血管，卻對表面皮膚影響極小，實現了無疤痕治療紅色胎記的愿望。治療紅色胎記的同時，對各種皮膚淺表的血管性疾病，如酒糟鼻、毛細血管擴張、毛細血管瘤等，同樣能夠較易地得到治療。雙脈沖激光治療紅色胎記不會損傷皮膚，所以治療后幾乎沒有瘢痕，可完全恢復皮膚本色。由于病損的血管在皮下呈立體分布，每次激光治療紅色胎記只能祛除部分血管，所以治療常需要分多次進行。
激光祛胎記關鍵是激光的選擇，色素型胎記的激光治療，以紅寶石激光為最佳選擇，現今的觀念是治療要趁早。以太田母斑為例，一般小孩需要4-5次治療，則需7-10次，所以要趁黑色素尚未堆積前去除較好。然而激光能去除胎記嗎的差異很大，有人效果顯著，有些人可能治療進度緩慢，所以要多給自己和醫生一點時間，充分評估后再接受治療。
另外，血管型胎記則一般以染料激光治療，但是效果及反應更難預期。如葡萄酒色斑可以用激光光將血管分層去除，通常第1、2次效果最顯著，可達50-60%，之后因殘留的血管愈來愈深，治療效果會遞減，通常需要高達7-10次治療。激光治療胎記雖然效果顯著，但費用昂貴，也不是每一種胎記都適合、而且需要用激光去除。最好請教專業醫師，做精確的診斷，判斷胎記對身體的影響，以及去除的需要。
