南方醫科大學深圳口腔醫院原名廣東省深圳牙科醫療中心，1983年2月創建，原直屬于廣東省衛生和計劃生育委員會，為非盈利性正處級公益二類事業單位。2016年底，醫院成建制劃轉南方醫科大學管理，更名為南方醫科大學深圳口腔醫院（廣東省深圳牙科醫療中心），成為大學直屬附屬醫院之一。醫院地處深圳市羅湖區建設路，緊鄰深圳火車站及羅湖口岸，是一家立足特區、面向港澳、服務珠三角的現代化口腔專科醫院。醫院建裝配國際先進口腔醫療設備，并全面實行“牙科四手操作”治療服務。舒適的環境、優質的診療服務，吸引了大批包括珠三角及港澳地區在內的患者就診。醫院同時承擔了深圳市保健辦的部分保健任務，贏得社會各界人士的贊譽，取得較好的社會效益和經濟效益，曾多次被評為國家級、省級文明先進單位