深圳市中醫院始建于1975年，下屬機構有深圳市中醫藥研究所、深圳市國際中醫藥人才培訓中心、深圳市中藥制劑中心。醫院于1995年成為三級甲等中醫醫院；1998年成為廣州中醫藥大學首家非直屬附屬醫院；2012年成為廣州中醫藥大學第四臨床醫學院，在深圳市基本醫療服務體系中醫藥領域中起著領頭羊的作用。2014年9月獲批立項的深圳市中醫院光明院區已于2017年10月破土動工。該院區規劃床位3000張，建筑面積52.98萬平方米。建成后，醫院將形成福田院區、光明院區、針灸醫院、科教中心“一院四區”的格局，成為國際化、大型現代化綜合性研究型中醫院和區域性中醫醫療中心。